國際扶輪位於美國伊利諾州埃文斯頓的總部, 為了執行各項服務計劃，國際扶輪分成扶輪社、地區、地帶和國際扶輪等不同的層次。各地的扶輪社皆由當地的社員組成，而國際扶輪則是由全球所有扶輪社組成，總部設在美國芝加哥郊區的埃文斯頓，負責各項行政管理作業。而全球各地多達三萬兩千多個的扶輪社則被劃分為529個地區和34個地帶。
社
每個扶輪社在國際扶輪規章制度下享有自主運作的權利，社長及幹部皆由社員從彼此之間選出，任期固定為一年。各扶輪社除了社長以外的幹部必須包括：理事、社長當選人（下一年度社長）、副社長、秘書和財務；剛卸任的上年度社長也是理事會的當然成員。而社長需任命四位服務主委，包括：社務服務，職業服務，社區服務和國際服務。
地區
全世界的扶輪社被分成529個地區，每個地區皆由一位地區總監負責領導，任期一年，地區總監由各地區內的扶輪社選出，為國際扶輪的職員。各地區的組織還包含助理總監及各種委員會，負責指導及支援該地區內各社運作。
目前全台灣分設有七個地區，香港、澳門與蒙古國則合設一個地區。
地帶
約15個地區組成一個地帶，每兩個地帶為一組，每組設有主持人，由兩個地帶內共同選出，任期兩年；主持人同時也擔任國際扶輪理事會的理事。
目前台灣、香港與澳門的八個扶輪地區與位於韓國南部的五個扶輪地區共組為第十地帶。
國際扶輪
國際扶輪是世界扶輪的管理機構，其主體為理事會，以當年度社長（任期一年）及社長當選人（下一年度社長），外加世界34個地帶選出的17位理事（任期二年），共19位組成，由當年度社長擔任理事會主席。
實際負責行政管理運作的是國際扶輪秘書處，並設有國際扶輪秘書長，為行政運作的最高負責人，管理約六百名職員以及七個國際辦事處，分別位於阿根廷、澳大利亞、巴西、印度、日本、韓國及瑞士。英國則另外設有「英愛國際扶輪辦事處」負責英國及愛爾蘭地區的扶輪事務。